Nature Genetics|重大突破,DNA去甲基化酶(TET2)新的功能:修饰RNA
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iNature:2018年2月27日,JianLong Wang研究组在Nature Genetics发表了题为 “RNA-dependent chromatin targeting of TET2 for endogenous retrovirus control in pluripotent stem cells”的研究论文,该研究论文揭示TET2在RNA的修饰中有重大作用,同时为RNA的转录后沉默提供了范例。 由于ERV再激活与衰老,癌症和自身免疫性疾病密切相关,研究结果也应该为通过RNA羟甲基化在健康和疾病中探索转录后ERV控制开辟新的途径。
TET蛋白通过与干细胞和癌症生物学相关的表观遗传机制保持适当的基因表达模式。对哺乳动物基因调控和染色质动力学中的TET功能的广泛研究突出了许多序列特异性DNA结合转录因子例如NANOG,PRDM14,PU.1和WT1对5hmC的特异性产生有重要作用,导致靶基因的活性去甲基化。鉴于RNA的5mC修饰已经确立,TET蛋白在介导RNA中5mC至5hmC氧化中的潜在作用刚刚开始受到重视。
多能小鼠胚胎干细胞(胚胎干细胞)来源于植入前胚泡的内细胞团。 ESC特征性抑制大多数ERVs的转录,但在具有扩大的效力的双细胞(2C)样群体中MERVL活性是不断波动的。胚胎干细胞表达甲基化和去甲基化途径的所有成分,在DNA水平检测到5mC的所有氧化形式。尽管对TET蛋白在基因组调控中的作用进行了广泛的研究,但很少人知道它们在控制ERV中的功能,ERV占小鼠和人类基因组的8-10%。
文章模型
在这里JianLong Wang研究组了确定了小鼠胚胎干细胞中的TET2作用组学,并将RNA结合蛋白PSPC1确定为TET2的结合配偶体。显示TET2可以通过与PSPC1的物理关联以RNA依赖性方式招募到染色质。通过鉴定PSPC1的RNA靶标,JianLong Wang研究组证实PSPC1在与MERVL转录物结合的同时,通过HDAC1 / 2介导的抑制和RNA羟甲基化(5hmC)介导的降解,招募TET2功能用于MERVL的转录和转录后调节。
原文链接:
https://www.nature.com/articles/s41588-018-0060-9
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